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该意见第四条第(四)款规定了三类国家科技创新基地的评价指标体系：科学与工程研究类基地重点评价原始创新能力、国际科学前沿竞争力、满足国家重大需求的能力;技术创新与成果转化类基地重点评价行业共性关键技术研发、成果转化应用能力、对行业技术进步的带动作用;基础支撑与条件保障类基地重点评价科技创新条件资源支撑保障和服务能力。对不同类型的基地，因其功能定位不同，评价重点也不同，应根据其功能定位设定评价指标体系，而指标体系必须充分反映其功能定位，这样才能通过评价促使各类基地履行其职能，实现其目标。
总的来说，对机构的评估要抓住两点：一是分类，根据该机构的功能定位和科研活动类型设置评价指标，对应用技术开发、成果转化活动，采取市场评价方式，成果转化情况作为主要评价指标之一，并依据科技成果转化情况年度报告进行科技成果转化绩效评价;二是评价周期，以中长期为主，并进行年度抽查。
引用资料：专利如何申请？具体流程和步骤介绍