税务机关对企业申报的研发项目有异议时，由企业提供科技部门的鉴定意见，这
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企业享受研发费用加计扣除时必须在年度申报时向税务机关提供全部有效证明，税务机关对企业申报的研发项目有异议时，由企业提供科技部门的鉴定意见，这样对吗？
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错误。按照《财政部国家税务总局关于完善研究开发费用税前加计扣除政策的通知》（财税〔2015〕119号）
五、管理事项及征管要求：
3.税务机关对企业享受加计扣除优惠的研发项目有异议的，可以转请地市级（含）以上科技行政主管部门出具鉴定意见，科技部门应及时回复意见。
企业承担省部级（含）以上科研项目的，以及以前年度已鉴定的跨年度研发项目，不再需要鉴定。
也就是说税务机关对企业享受加计扣除优惠的研发项目有异议的，企业无需举证，由税务部门直接跟科技部门协商。