目前，作为中国商品区域流通环节主体的代理商，由于受到上游生产企业、下游大型终端零售企业的共同冲击，业务职能有了一定的转化；同时，各级管理机关对代理商的财务正规化建设也加强了监督与管理，建立具有自身特点的财务管理系统，提升财务管理的能力与水平，成为代理商企业生存、发展的迫切需求。然而，在诸多因素影响下，代理商企业财务发展却面临许多难题。
1.由于代理商规模较小，尤其是私营代理企业，多数是大家所熟悉的“个体户”，虽然很多“个体户”现在已经成长为大、中型代理商，但仍缺乏正规、完善的现代化财务管理支持。
2.作为上游的生产企业，都希望代理商“专业化、单一”地从事本公司产品的分销工作，而控制代理商的一个重要手法，就是控制代理商的财务管理系统（或者是控制代理商本产品的财务管理系统）。因此，大型生产企业都会要求代理商使用自己全国统一的、甚至专为中国市场设计的“营销业务”（其中包括大量的财务数据管理）管理系统。虽然这些先进的财务管理系统为代理商解决了许多问题，带来许多便利，但不能否认，生产企业通过它实现了对代理商财务（业务）的监控。而对于独立的、要求不断发展的代理商而言，如果代理多个知名品牌产品，就要建立多个财务管理体系，购置多部计算机，使用多种财务管理软件，相应地雇用多名财务管理人员，这样就很难形成有自己特色的财务管理体系。
3.作为大型零售终端，往往会要求代理商的财务管理与他们相“吻合”，包括结算管理、商品退货管理等。大型连锁零售企业使用某种财务软件，必然要求代理商的财务管理软件与之相配合。虽然大型零售企业不会硬性要求，但由于其把握着代理商的经济脉搏，代理商的财务管理不得不与大型零售企业相适应。一方面这是对代理商财务管理的推进，但另一方面，它也限制了代理商自身财务管理系统的建设。
4.代理商虽然数量众多，但属于“弱势群体”，呈现数量巨大、规模弱小、利润趋于下降的特点；并且代理商既不是高新技术产业，也不属于国家扶植产业，因此，没有受到相应管理部门的重视。尤其是财务管理的相关部门，只是一味地对代理商进行硬性管理，基本上没有政策、方案方面的倾斜，这也成为影响代理商企业建立自己的财务管理系统的困扰因素之一。
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