伴随着自贸区税收合规重要作用与积极意义的日益普及，中小企业在经营管理过程中，也越来越重视企业自贸区税收合规工作地开展。不过，由于中小企业普遍缺少专门的财务部门设置，因而，其在开展税收合规的过程中，极易面临一系列的税收合规风险。接下来，本文将对此进行简要说明。
首先，中小企业开展税收合规，会面临税收合规基础不稳而导致的合规风险。在现实社会经济中，中小企业进行税收合规需要具备良好的基础条件。所谓税收合规基础条件，是指企业的管理决策层和相关人员对税收合规的认识程度，企业的会计核算和财务管理水平，企业涉税诚信等方面的基础条件。但事实上，中小企业管理决策层对税收合规普遍缺乏必要的了解和重视，而且中小企业极易出现会计核算不健全、账证不完整、会计信息失真等问题，从而造成中小企业税收合规基础不稳固，具有较强的合规风险。而这，也是中小企业开展税收合规最主要的风险。
其次，中小企业进行税收合规，会面临税收政策变化导致的合规风险。税收政策变化是指国家税收法规时效的不确定性。随着市场经济环境的发展变化，国家产业政策和经济结构的调整，税收政策总是要进行相应的变更，以此来适应国民经济发展的需要。所以，有关中小企业的税收优惠政策也处于不断变化之中。由于税收合规是事前合规，税收合规方案的实施都需要一个过程。因此，如若在此中小企业开展税收合规期间，其税收政策发生相应变化，就有可能使得依据原税收政策设计的税收合规方案变为不合法方案，进而导致中小企业税收合规风险。
再次，中小企业税收合规还面临着税收合规目的不明确而导致的合规风险。税收合规活动是企业财务管理活动的一个组成部分，实现税后利润最大化只是税收合规的阶段性目标，而实现纳税人的企业价值最大化才是它的最终目标。因此，中小企业开展税收合规，必须对税收合规的目的进行明确，而不能盲目追求短期的经济效益。即如果合规方案的制定不符合企业生产经营的客观要求，税负抑减效应行之过度而扰乱了企业正常的经营理财秩序，那么将会导致企业内在经营机制的紊乱，最终将招致企业更大的潜在损失风险的发生。所以，中小企业开展税收合规，还需从长远发展的角度明确税收合规目标，量力而行。
当前，我国中小企业开展税收合规面临着很多的误区，对税收合规的认识、操作手段和操作方法的掌握也存在着缺陷。因而，在这样的状态下开展企业税收合规，其具体合规行为很可能会为企业带来一系列的财税风险，合规的结果也往往不尽如人意。因此，建议有税收合规意向的中小企业，在开展税收合规之前要寻求当地专业的财务公司进行详情咨询，这样才能够使税收合规方案的制定更符合企业的具体经营实际，也才能够确保税收合规工作地开展达到企业预期的目标和效果。
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